自營電商倉庫運營面臨的主要問題包括：

　　1. 倉儲成本高：自營電商倉庫通常需要投入大量資金用于建設、租賃、裝修、設備購置和維護等方面，因此倉儲成本較高，對于中小型電商來說，這可能會成為一項重要的財務負擔。

　　2. 物流配送難度大：電商倉庫通常需要面臨大量的訂單處理和物流配送工作，這需要高效的物流管理和配送系統來支持，否則會導致訂單處理滯后、配送延誤等問題。

　　3. 庫存管理復雜：電商倉庫通常需要管理大量的庫存，而且要及時進行采購、入庫、出庫、盤點等工作，如果管理不當，會導致庫存過多或缺貨情況的出現，從而影響銷售業績。

　　4. 人員管理難度高：電商倉庫需要大量的人員來支持倉庫管理、訂單處理、物流配送等工作，而且這些人員需要具備相關的技能和經驗，否則會導致工作效率低下、錯誤率高等問題。

　　5. 資源浪費和環境污染：電商倉庫通常需要處理大量的包裝材料、退貨物品等廢棄物，如果處理不當，會浪費大量的資源并造成環境污染。

　　以上是博程云倉總結的自營電商倉庫運營面臨的一些主要問題，針對這些問題，需要采取有效的管理措施來降低成本、提高效率和減少環境影響。